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    主页 &amp;gt; 技术服务 &amp;gt; Mulitiplex Snapshot多重SNP分型技术

    Mulitiplex Snapshot多重SNP分型技术

    Mulitiplex Snapshot多重SNP分型技术

    技术简介:

           针对性的解决多个SNP位点(8-16个)的基因分型项目,样本量灵活,从几百到上千个样品。

    技术方法:


          我公司利用由美国Life Technologies公司开发的SNaPshot技术,针对中等通量的SNP分型项目进行了技术上的改进大大提高了分型的通量和准确性。SNaPshot又称为小测序技术,是在一个含有测序酶,四种荧光标记的ddNTP,紧挨多态位点5’端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪跑胶后,根据峰的颜色可知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。通过针对不同的SNP位点设计不同长度的延伸引物来做到多个SNP在一个反应体系中进行分型,目前我们已经可以做到15个位点同时分型通量。由于此方法为四色荧光标记,所以可以针对各种SNP类型进行分型,同时还可以对插入、缺失进行分析。

          技术体系的示意图如下:

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    应用领域:


          本方法适用于多个涉及到SNP分型的遗传研究领域。尤其适合针对全基因组SNP关联研究获得的初步阳性位点,以及全基因组测序得到的大量初筛突变位点进行进一步的大样品验证研究。

    检测对象:

          基因组DNA

    服务内容:

          课题的设计咨询包括检测位点的选取;
          DNA样本的质检与标化;
          SNP分型所用引物的设计、合成与优化;
          Multiplex SNaPshot SNP分型;
          分型数据的分析与结果报告。

    检测实例:

  1. 12个SNP位点的分型图

    单个位点分析图(位点RSxxxxxx)

  2. 样本1, 基因型A/A

  3. 样本2, 基因型G/G

  4. 样本3, 基因型G/A

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